Με απόφαση που συνυπογράφουν ο Υφυπουργός Οικονομίας, Ανάπτυξης και Τουρισμού Αλέξης Χαρίτσης και ο Υπουργός Παιδείας, Έρευνας και Θρησκευμάτων, Νίκος Φίλης, (ΦΕΚ 365 | 17 Φεβρουαρίου 2016) ιδρύεται από το σχολικό έτος 2016−2017 το 2ο Σχολείο Δεύτερης Ευκαιρίας στα Χανιά και συγκεκριμένα στο Κατάστημα Κράτησης «Κρήτη 1». 

Το Σχολείο συγχρηματοδοτείται από τα προγράμματα ΕΣΠΑ.