Μεταξύ τους κληρώθηκαν, έπειτα κι από σχετικό αίτημα που είχαν καταθέσει, οι κρητικές ομάδες της Γ’ Εθνικής, στον 4ο όμιλο του Κυπέλλου.

Η ΑΕΕΚ ΙΝΚΑ θα φιλοξενήσει τον Εργοτέλη, ενώ ο ΠΟΑ θα υποδεχτεί τον Ερμή Ζωνιανών. Στην επόμενη φάση ο νικητής του ΙΝΚΑ-Εργοτέλης θα παίξει εντός έδρας με τον νικητή του ζευγαριού Κηφισιά-Προοδευτική και ο νικητής του ΠΟΑ-Ερμής θα αντιμετωπίσει εκτός έδρας τον νικητή του Ηλυσιακός-Ιωνικός.

Αναλυτικά η κλήρωση:

1η φάση
16 Οκτωβρίου

Ρόδος-Ιάλυσος (16)
ΠΟΑ-Ερμής Ζωνιανών (17)
ΑΕΕΚ ΙΝΚΑ-Εργοτέλης (18)
Κηφισιά-Προοδευτική (19)
Ηλυσιακός-Ιωνικός (20)
Άγιος Ιερόθεος-Θύελλα Ραφήνας (21)
Τριγλία Ραφήνας-Εθνικός (22)
Χωρίς αγώνα προκρίνεται ο Πανθηραϊκός

2η φάση
13 Νοεμβρίου

Νικητής 21-Νικητής 22 (23)
Νικητής 18-Νικητής 19 (24)
Πανθηραϊκός-Νικητής 16 (25)
Νικητής 20-Νικητής 17 (26)

Ημιτελική φάση
14 Δεκεμβρίου

Νικητής 23-Νικητής 24 (27)
Νικητής 26-Νικητής 25 (28)

Τελικός 4ου ομίλου
29 Μαρτίου 2017

Νικητής 27-Νικητής 28