Ο Επίσκοπός Ευγένιος ορίσθηκε Εκπρόσωπος της Ιεράς Επαρχιακής Συνόδου της Εκκλησίας της Κρήτης στο Διοικητικό Συμβούλιο της Ορθοδόξου Ακαδημίας Κρήτης για τη διετία 2016-2017. Η σχετική απόφαση λήφθηκε κατά την τελευταία Συνεδρία της Συνόδου, που πραγματοποιήθηκε την 3η Μαρτίου 2016.
Ο Σεβ. Μητροπολίτης Ρεθύμνης και Αυλοποτάμου κ. Ευγένιος με πολλή χαρά αποδέχθηκε την τιμή της Εκκλησίας και τη διακονία αυτή.