Στο Μουσείο γίνεται έκθεση απολιθωμάτων, ένα μαγευτικό ταξίδι στο γεωλογικό χρόνο που ξεκινά πριν από 300 περίπου εκατομμύρια χρόνια και έχει αποτυπωθεί σε ιζήματα και πετρώματα του Ρεθύμνου και της Κρήτης. Δίδεται έμφαση στα πλειστοκαινικά ελάφια, ελέφαντες και άλλα ζώα που ζούσαν μέχρι και πριν από 10000 χρόνια π.Χ. στο νησί.
Στα εκθέματα μεταξύ των άλλων περιλαμβάνονται χαυλιόδοντες, κέρατα, σκελετοί και οστά, που έχουν ανασκαφεί κυρίως σε παράκτια σπήλαια δυτικά της πόλης του Ρεθύμνου.
Για πληροφορίες ραντεβού τηλέφωνο: 2831023083
Το παλαιοντολογικό Μουσείο στεγάζεται στο Τέμενος Μασταμπά – Βελή Πασά Τζαμί, στην οδό Σάθα και Μαρκέλλου, τέλος οδού Δημοκρατίας.